Série documental composta por um livro com o assento dos assuntos discutidos em reuniões da Mesa da Irmandade e que requereram votação: os provimentos de dotes a órfãs, eleições de cargos da Irmandade e Mesa, empréstimos a juro, entre outros.
Série constituída por três maços com documentos de diversas tipologias, a saber: portarias, provisões, alvarás, escrituras de empréstimo, de dívida, de distrate, de venda, de compra, de partilhas e de quitação, arrematações, acórdãos, execuções, autos de posse, penhoras, relação de rendimentos, avaliação de propriedades, relações de dívidas, contas correntes de dívidas, relações de bens hipotecados, procurações, pareceres, informações, requerimentos, ofícios, certidões de óbito e recibos, sendo alguns originais e outros cópias, traslados ou certidões.
Série documental constituída por onze livros destinados ao registo diário das receitas e despesas da Irmandade do Santíssimo Sacramento. No primeiro livro, iniciado em 1822, quando se procedeu a uma reforma da escrituração contabilística da Irmandade, regista-se sequencialmente as receitas e despesas, organizadas cronologicamente, pela data em que se efectuam os recebimentos e pagamentos. A partir de 1844, já no segundo livro, os assentos da receita aparecem separados dos da despesa (os primeiros à esquerda e os segundos à direita), com o saldo no final de cada ano civil. A partir de 1859 (segundo as Instruções do Governo Civil de Lisboa de 15 de Novembro de 1859, Art.º 14.º, §º único), no final de cada ano económico, apresenta um termo de encerramento das contas da receita e despesa da Irmandade, assinado pelos membros da Mesa, surgindo também uma anotação do escrivão em como as contas tinham sido aprovadas em Conselho de Distrito e data de aprovação (Instruções…, Art.º 26.º). As verbas da receita são rubricadas pelo tesoureiro e pelo escrivão e as verbas da despesa são rubricadas apenas pelo escrivão (Instruções…, Art.º 13.º). A partir de 1937 os termos de encerramento das contas aparecem no final de cada ano civil (Decreto-lei n.º 25299, de 6 de Maio de 1935).
Série documental constituída por três livros contendo os assentos diários da receita e despesa da Irmandade do Santíssimo Sacramento, referentes ao Cofre dos Socorros.
Série documental constituída por um livro no qual, segundo consta do texto do termo inicial (f. 1) assinado pelos membros da Mesa da Irmandade, se deveriam descrever, em forma de inventário, os bens, todas as acções activas e passivas da Irmandade e em seguida os movimentos de receita e despesa, lançados mensalmente. Em sessão de Mesa da Irmandade de 1806-01-01, resolvera-se "mudar de método e estabelecer huma forma de Escripturação tanto clara como fácil de pôr em pratica por quaisquer pessoas".
Série constituída por quatro maços, contendo documentos de diversas tipologias, a saber: portarias, cartas régias, acórdãos e ordens da Mesa, requerimentos, ofícios, exposições, propostas, representações, informações, procurações e inventários. Inclui ainda orçamentos da receita e despesa, cadernos de contas correntes, borradores dos livros Cofre, Diário, Razão e Ordens de despesa, balanços da receita e despesa, contas e mapas de receita e despesa. Originalmente existiam apenas três maços, porém, por questões de melhor conservação, o Maço 2 foi dividido em dois maços diferentes (ficando com ref.ª e cota idêntica, acrescida das letras a e b).
Série documental constituída pelo conjunto de documentos comprovativos das receitas e despesas efectuadas pela Irmandade do Santíssimo Sacramento, organizados cronologicamente, por anos económicos ou civis (a partir de 1936), acondicionados em dezoito caixas. Este conjunto documental reúne os documentos contabilísticos tanto da Irmandade como da Fábrica da Igreja e ainda os relativos à conta corrente dos testadores. No início a organização dos documentos é numérica sendo que, a partir de 1854 (não existem os anos de 1852 e 1853), os documentos estão organizados por anos e por verbas orçamentais. A partir de 1866 e até 1882 (não existem também os documentos de 1883 a 1933), apenas existem os documentos de despesa referentes às esmolas concedidas aos paroquianos pobres e os da receita limitam-se aos mapas com a receita da Fábrica e aos comprovativos dos rendimentos provenientes dos peditórios do Santíssimo Sacramento. Nos documentos de despesa estão apostos o respectivo despacho de autorização pela Mesa da Irmandade. Em anexo aos documentos das ordens de pagamento ou recibos encontram-se frequentemente outras tipologias documentais, constituídos geralmente por cópias ou públicas-formas, como sejam, certidões, procurações, atestados e outros, que serviam de suporte ou justificação da despesa ou da receita. Nalguns anos existe ainda em anexo ao processo anual, os orçamentos e contas da receita e despesa da Irmandade (ver série com ref.ª PT-INSE-ISSIE/GF/01).
Foi nomeada uma Comissão Administrativa por Alvarás do Governo Civil de Lisboa, datados de 21 de Outubro e 15 de Dezembro de 1858 (Ver Livro de Actas n.º 1, f. 121 v.º e Livro de Posses f. 120). A Comissão Administrativa tinha como missão principal a elaboração de um novo Compromisso para a Irmandade do Santíssimo Sacramento. Esta Comissão funciona até 1862, organizando a eleição da nova Mesa da Irmandade, que iniciaria funções a partir daquela data, quando acabassem os trabalhos da Comissão, o que veio a suceder na sessão de 10 de Julho de 1862, estando presente também a Mesa entretanto eleita (Ver Livro de Actas n.º 2, f. 36 v.º). Os maços de documentos que constituem esta série, embora de origem e conteúdos diferentes, foram organizados pela Comissão Administrativa no âmbito da sua actividade.
Série composta por um livro que inclui as contas correntes da Irmandade do Santíssimo Sacramento com os contribuintes para o empréstimo gratuito, indicando-se os valores entregues pelos contribuintes e os pagamentos da Irmandade aos contribuintes, mediante a apresentação da Apólice respectiva.
Série documental constituída pela colecção de exemplares dos compromissos e estatutos pertencentes a outras irmandades e confrarias que serviram de base, ou como exemplo, à elaboração de estatutos da Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja da Encarnação.
Esta série inclui dois estudos e projectos de acabamento ou remodelação e um relatório de vistoria ao estado de conservação da Igreja de Nossa Senhora da Encarnação: o projecto de obra de acabamento da frontaria da Igreja em 1866-1867, o projecto promovido pela Irmandade para remodelação e ampliação dos anexos da Igreja em 1984 e o relatório da vistoria realizada antes da construção do parque de estacionamento subterrâneo, na Praça Luís de Camões, em 1999.
Aqui se agruparam todos os estudos, projectos, minutas e outros relativos à elaboração dos vários Compromissos e Estatutos da Irmandade do Santíssimo Sacramento.
Série documental constituída por um livro, apresentando o registo de ordens de pagamento, organizado por verbas orçamentais.
Conjunto de fichas onde se encontram individualizadas as descrições do edifício da Igreja, dos prédios e casas que constituíam os bens imóveis da Irmandade do Santíssimo Sacramento, seguidas das referentes aos paramentos e alfaias.
Série constituída por um ficheiro dos irmãos da Irmandade do Santíssimo Sacramento, organizado alfabeticamente pelos seus nomes (primeiro pelo apelido e depois pelos nomes próprios).