Certidões anuais das missas celebradas pelos capelães da Capela instituída pelo Padre Manuel Sousa Caldeira, os pagamentos efectuados pela Irmandade do Santíssimo Sacramento como administradora da Capela e certidões do cumprimento e obrigação da Capela, emitidas pelo Provedor dos Órfãos e Capelas. Testador: Padre Manuel Sousa Caldeira. Capelão: Padre Francisco Pedro de Abreu.
Assento de uma única certidão do cumprimento das missas e de confissões realizadas pelo capelão, conforme as cláusulas da Capela instituída pelo Padre Pascoal da Costa, cura da Freguesia de Nossa Senhora da Encarnação. A certidão diz respeito ao cumprimento das obrigações da Capela no período compreendido entre 1762-02-15 e 1766-12-[31]. Testador: Padre Pascoal da Costa. Capelão: Tomás António Ribeiro de Carvalho.
Conjunto documental relativo ao exercício dos poderes de ordem do reitor, ou seja: a proclamação da palavra de Deus, a santificação dos fiéis e a administração dos sacramentos. Integra documentos destinados a registar os atos de culto, os sacerdotes que os celebram, as intenções dos fiéis, as peregrinações e a administração dos sacramentos do batismo e do casamento, assim como Programas Pastorais. Inclui também documentos de despesa e registos de receita e despesa elaborados por D. Maria de Jesus Atalaya, entre 1961 e 1992. A capela manteve contabilidade autónoma, desde 1960 a 1977. Esta secção inclui uma subsecção com a documentação produzida pelo Vicariato Paroquial de Cristo Rei que existiu entre 1977 e 1999, para manter a ligação à diocese de Lisboa do território onde estava o Santuário e o Seminário de S. Paulo.
Certidão dos autos de conta da capela instituída pelo Capitão João de Morais e Silva e administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau.
Certidão da capela instituída pelo padre António Furtado de Mendonça em 1742.
Capela instituída pelo padre Luís Martins da Cunha e administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau.
Capela instituída pelo padre Manuel Vilas Boas e administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau.
Capela instituída por Amaro de Cerqueira, que era administrada pelas "religiosas do Bom Sucesso".
Capela instituída por António da Silva, administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau.
Capela instituída por António da Silva no valor de 1600$000 réis, administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau. Destina-se à doação de um dote de 60$000 réis anuais a uma órfã.
Capela instituída por António Rodrigues de Matos e administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau.
Capela instituída por Domingos Martins, administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau. Inclui uma certidão do escrivão José da Cunha Machado; um testamento de Domingos Martins e sua cônjuge, com respectiva aprovação e tombo.
Autos de conta da capela instituída por Estevão Rodrigues e administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau.
Capela instituída por Fernão da Cunha e sua cônjuge, Francisca da Conceição, administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau.
Autos da conta da capela instituída por Francisco Carlos na freguesia de São Nicolau, administrada pela Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja de São Nicolau.