Série constituída por um livro de registo de rendas, abarcando o período entre o primeiro semestre de 1812 e o segundo semestre de 1817. Existem listas semelhantes com os rendimentos das propriedades no livro com a ref.ª PT-INSE-ISSIE/GP/PR/01-02. Este registo parece ter servido de base para serem emitidos os recibos de rendas, todos os semestres, para serem entregues ao cobrador da Irmandade e este poder colectar os inquilinos.
Série constituída por um livro em que se regista a matrícula dos inquilinos das casas que constituíam propriedade da Irmandade.
Série constituída apenas por um livro, em que se registam os valores das jóias prometidas por cada um dos mesários e mordomos da Irmandade do Santíssimo Sacramento. No título inscrito em cada folha indica-se o ano de gerência da Mesa da Irmandade e nos registos assenta-se o cargo, o nome e o valor que fora prometido pagar de jóia.
Série constituída por dois livros com registos da admissão de irmãos na Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja da Encarnação, organizados cronologicamente. Os registos indicam a data do assento, o nome do irmão admitido, a morada, o estado civil e, se casado ou viúvo, o nome da esposa e a quantia entregue de jóia pela sua entrada. À margem do assento inscrevem-se diversas anotações, que variam conforme os casos: falecimento, ausência, mudança de morada ou estado civil, indicando, por vezes, as datas dos acontecimentos ou dos assentos. Os dois livros possuem ainda um índice alfabético inicial (no primeiro livro) ou final (no segundo), com o nome do irmão e a folha onde consta o respectivo assento.
Conjunto de documentos, com várias tipologias, algumas em modelos impressos. O primeiro conjunto, organizado cronologicamente, é constituído apenas por propostas de novos irmãos. No segundo maço, além das propostas de irmãos, existem ainda folhas de anuais e no terceiro incluem-se ainda listas de irmãos e documentos referentes a protocolo a seguir na admissão e posse (obrigações, direitos, compromisso e oração).
Série constituída por três livros, organizados cronologicamente pela data de admissão na Irmandade. Os dois primeiros livros são impressos. O terceiro livro é diferente dos primeiros, reaproveitado de outro tipo de livro não utilizado e usado para o registo da descarga das quotas dos irmãos, mas os elementos informativos são os mesmos dos livros anteriores. A cada página corresponde os pagamentos relativos a cada um dos irmãos, no período a que respeitam. Os dois primeiros livros possuem índice inicial, com marcadores alfabéticos, indicando o nome do irmão e página em que se encontra o registo do livro de receita com o pagamento das quotas anuais.
Série constituída por um único livro destinado ao controlo do pagamento das quotas anuais pelos irmãos da Irmandade do Santíssimo Sacramento.
Série formada por um único livro, contendo os assentos dos termos de provimento de pessoas que trabalhavam para a Irmandade do Santíssimo Sacramento.
Série constituída por um pequeno conjunto de cartões, que serviam para ser distribuídos aos irmãos que participavam nas procissões e outras festividades promovidas pela Irmandade ou em que esta participava, com a atribuição das suas funções.
Esta série documental, composta por três livros, inclui as actas das sessões da Mesa da Irmandade do Santíssimo Sacramento, no período de 1803 a 1893, excepto no período de 1858 a 1862, em que as actas transcritas se referem às sessões da Comissão Administrativa da Irmandade. As actas das sessões de Mesa da Irmandade continuam na série de Actas das Sessões da Mesa e Assembleia-geral da Irmandade a partir de 1894 (ver série com ref.ª PT-INSE-ISSIE/AO/05). Em cada sessão de Mesa são apresentadas as propostas, petições, consultas, reclamações, avisos, etc. e depois a resolução da Mesa relativa ao assunto exposto. Temática dos assuntos levados à Mesa: nomeação da Mesa e definidores, apresentação de contas, provimento e despedimento de pessoal contratado, admissão de novos irmãos, realização de obras na Igreja, dívidas e empréstimos, festividades, tabela de emolumentos, relação com inquilinos, devedores, prior da Igreja, entre outros. Existem ainda um subconjunto documental que corresponde a dois maços com documentos de natureza distinta, reunidos pela Comissão Administrativa (1859-1861) - ver subsérie com as ref.ª PT-INSE-ISSIE/AO/01/01.
Série composta de dois livros com o registo de acórdãos da Irmandade do Santíssimo Sacramento da Igreja da Encarnação. Tem transcrição autenticada das escrituras celebradas entre o Cabido da Sé de Lisboa e a Condessa de Pontével, D. Elvira Maria de Vilhena, relativamente à fundação e edificação da Igreja com o título de Nossa Senhora da Encarnação e a que concede a Fábrica da Igreja e rendimento dos covais e sepulturas no corpo da Igreja à Irmandade do Santíssimo Sacramento, em contrapartida do cumprimento das obrigações descritas no mesmo documento. Apresenta ainda o registo de termos de aceitação de legados, avaliação de casas recebidas por doação ou testamento, de instituição de capelas, nomeação de dotes instituídos pelos testadores, acórdãos relativos a dinheiro que se deu a juro, cofre de três chaves com dinheiro da Irmandade, provimento e despedimento de capelães, provimento de meninos de coro e sacristia, acórdãos relativos à nomeação de um Procurador-geral, sobre a aposentadoria do andador, provimentos do andador, sineiro e outros empregados, aumento de ordenados, sobre a reedificação e obras na Igreja, para se edificarem casas por detrás da Igreja para aluguer, entre muitos outros assuntos.
Série documental constituída por dois livros que serviam para os irmãos da Irmandade do Santíssimo Sacramento assinarem os seus nomes, quando se realizavam reuniões da Assembleia-geral da Irmandade, comprovando-se assim a sua presença nas mesmas.
Correspondência recebida e expedida pela Irmandade de S. Miguel e Almas.
Organizado inicialmente como um Livro Caixa (tipo partidas dobradas), em que se indicava a data, o descritivo da receita ou da despesa e os valores em papel, em moeda e o total. A partir de 1844 descrevem-se a receita e despesa classificada pelas diferentes espécies de receita ou de despesa, segundo as Instruções emanadas do Governo Civil de 1838 e 1843 e passa a designar-se por Conta Geral da Receita e Despesa. O segundo livro já está organizado também por espécies, ou rubricas, do orçamento. As Contas são anuais, procedendo-se ao ajuste das contas pela Mesa da Irmandade, que depois eram enviadas para o Conselho de Distrito para aprovação. No final da folha do termo de ajuste, era assente a data da sessão do Conselho em que as Contas da Irmandade eram aprovadas. Faltam as contas de 1859 a 1878.
O livro Diário constituía outro dos livros obrigatórios segundo as Instruções do Governo Civil de 1843, em que se lançavam o “recebido e expedido diariamente”. Tem no fim de cada ano a aprovação da Mesa.